第213章计算生物学研究四
第213章计算生物学研究四(第2/3页)
量,强行纳入了微分方程的解空间。
「既然关不紧水龙头,那就计算水滴漏下的频率,然后……利用它。」
十分钟后,回车键敲响。一个新的数值跳了出来。
「老刘,把诱导剂iptg的浓度,从0.1mm降到0.005mm。我们做一点『微调』,一点一点地把它的活性逼到那个临界点上。」
「0.005mm?」刘伟瞪大了眼睛,差点以为自己听错了,「这也太低了吧?这跟没加有什麽区别?这完全是顺势疗法的浓度啊!这能行吗?」
「如果不信数学,我们还有别的选择吗?」徐辰反问道,目光灼灼,「如果不靠计算,让你凭经验去试,你会试0.005这个浓度吗?」
刘伟愣了一下,摇摇头:「不会,正常人起码从0.05起跳。」
「这就对了。」徐辰指了指脑袋,「生物系统的复杂性就在于它的非线性。那个能打开宝库的『芝麻开门』的频率,往往藏在人类直觉的盲区里。第一次我大意了,把地图画错了一角。现在地图修好了,除了跟着地图走,我们在黑暗中别无他法。」
「相信数学。在混沌的生物系统里,它是唯一的火把。」
……
调整方案后,实验继续进行。
「徐神,这组菌长得有点慢啊,od600才0.4,是不是诱导剂加多了?要不要补点葡萄糖?」刘伟看着分光光度计的读数,有些担忧。
「不,别动。」徐辰盯着电脑屏幕上的模拟曲线,冷静地说道,「模型显示这是正常的代谢切换期。细胞正在重组胞内的酶系,适应新的碳通量分配。这是黎明前的黑暗,再等两小时,od值会指数级上升。」
徐辰心里暗道:要是这时候加了葡萄糖,就会触发『碳分解代谢物阻遏效应』,之前的调控就全白费了。生物学直觉有时候会骗人,就像女人的第六感,虽然准,但偶尔也会把你带沟里去。但微分方程不会,它是绝对理性的渣男,只讲逻辑,不讲感情。
「老刘,这组样品的淬灭时间要精确到秒,准备好液氮。我们要捕捉的是胞内代谢物的瞬时浓度。」
「放心,掐表吧。」
……
两周后,凌晨两点。
实验室里只剩下高效液相色谱仪(hplc)发出的低沉嗡嗡声。这台昂贵的仪器正在分离发酵液中的各种有机酸,并将它们转化为电信号。
当最后一组样品的分析图谱在屏幕上缓缓绘制出来时,原本困得直打哈欠丶手里还捏着半个面包的刘伟,突然猛地凑近屏幕,眼珠子瞪得溜圆。
「卧……卧槽?!」
「怎麽了?」徐辰凑过来。
「徐辰,你过来看!」刘伟指着屏幕上那个高耸入云的特徵峰,声音都变调了,「这是琥珀酸的峰?你确
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